ASSESSMENT OF THE POTENTIAL USE OF SOIL AS A SOURCE OF POTENTIAL PROBIOTIC CROPS



Cite item

Full Text

Abstract

Background. The role of probiotics in the health of the body is great, probiotic drugs restore normal mobility of the mucous surface of GECT, have immunomodulating properties. The most studied sources of probiotic cultures are dairy products. The possibility of applying bioengineering strains with specified properties has also been recently considered. There are a number of unresolved issues in this approach, but with the development of biotechnology it seems promising.

Aim - analysis of soil microorganism species diversity in the Samara region with description of major groups of potentially probiotic microorganisms.

Methods. We conducted a microbiological evaluation of agricultural soils. 75 soil samples were collected. For the bacteriological study, nutritional media were used: universal chromium agar, Mller-Hinton agar with 5% sheep’s blood added, Middlebrook agar, Rhagia agar, mannitol salt agar, Brucella spp., agar for Burkholderia cepacia complex (BCC), xylo-lysine deoxycholate agar, cetrimide agar, differential agar of Reddy, glucosamine agar of Ashby, agar for Clostridium spp., anaerobic agar, differential Regdi agar, Saburo agar and granulated Chapeca-Dox agar. Seeding samples was carried out by the Drigalski method. The identification of colonies of microorganisms was carried out using MALDI-ToF mass spectrometry on the Microflex LT.

Results. In all soil samples were found the main representatives of typical gastrointestinal tract inhabitants used as probiotics: Bacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, Lactobacillus, Ligalactobacillus, Streptococcus. 45 Bacillus species were identified. Among the members of the genus Lactobacillus the most frequently encountered were: L.jensenii and L.sakei (in 50,7% of samples), L.plantarum (in 46,7%). Lig. agilis was the most commonly encountered - in 32% of samples, also one of the important microorganisms used in probiotic preparations, Lig. salivarius was isolated in 24% of the samples. Enterococcus faecium was detected in 68% of the samples. Bacteria of the genus Streptococcus are not typical of human gastrointestinal tract microorganisms found in 4% of samples of Str. salivarius is the dominant representative of normal oral flora throughout a person’s life.

Conclusion. From the data obtained, it can be seen that the identified microorganisms living in soil cover can be used to develop new probiotic drugs. Thus, most of them are used in clinical practice for use in the gastrointestinal tract (Bacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, Lactobacillus, Ligilactobacillus).

Full Text

ВВЕДЕНИЕ.

В последнее время роль пробиотиков в коррекции нарушений кишечной микробиоты постоянно пересматривается и дополняется. Пробиотические препараты оказывают комплексное воздействие на организм человека. Помимо основной функции - колонизации слизистых оболочек и как следствие восстановление нормобиоты, также широко обсуждаются иммуномодулирующие функции пробиотических штаммов: активация локальных клеток иммунной системы, продукция биологически активных молекул (ацетат, пропионат, бутират), изменение уровня про- и противовоспалительных цитокинов [1].

К используемым в пробиотических препаратах, относятся бактерии родов Bifidobacterium, Lactobacillus, Escherichia, Enterococcus, Aerococcus, Streptococcus, а также некоторые виды дрожжей, например, Saccharomyces. Основные представители пробиотиков представлены в табл. 1. Один из самых широко применяемых и изученных микроорганизмов – штамм Lactobacillus rhamnosus GG (LGG). Также используют Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium, однако данные микроорганизмы относятся к условнопатогенным, поэтому требуется проверка на отсутствие в геноме пробиотической культуры генов протеолитических ферментов, различные генов вирулентности, кодирующих синтез адгезинов. Представители родов Bifidobacterium и Streptococcus B.lactis (BB12) и S.thermophilus (TH4) используются с момента рождения ребенка. В пробиотических препаратах используют и самоэлеминирующиеся микроорганизмы, например, Bacillus subtilis, B.licheniformis, Saccharomyces boulardii [2].

Наиболее изученными источниками пробиотических культур являются различные продукты сбраживания, молочные продукты, ЖКТ человека [3]. Так же в последнее время рассматривается возможность применения биоинженерных штаммов с заданными свойствами. В данном подходе есть ряд нерешенных вопросов (контроль постоянства признаков, горизонтальный перенос генов), однако с развитием биотехнологий он кажется перспективным [4].

Всё большее внимание исследователи уделяют изучению не изолированных микроорганизмов, а их взаимодействию между собой и организмом хозяина. Почва является ключевым элементом системы взаимодействий «человек-микробиом-окружающая среда» [5, 6]. Почва является самым большим как по количественному, так и по видовому разнообразию местом обитания микроорганизмов [7, 8]. При этом она является крайне гетерогенной по видовому составу, который будет отличаться в зависимости от типа и состава почвы, климата, глубины и т.д. При этом и свойства микроорганизмов будут отличаться при изолировании их из различных географических ареалов. В почве встречаются основные рода микроорганизмов, используемые в пробиотических препаратах, такие как Bacillus, Bifidobacterium, Lactobacillus, Ligalactobacillus и др [9, 10].

Таблица 1.

Основные виды микроорганизмов, входящие в состав пробиотиков

Класс

Вид

Lactobacillus

L. rhamnosus

L. acidophilus

L. plantarum

L. reuteri

L. fermentum

L. lactis

L. casei

L. bulgaricum

Bifidobacterium

B. bifidum

B. longum

B. lactis

B. infantis

B. adolescentis

Streptococcus

S. thermophilus

Enterococcus

E. faecium

Saccharomyces

S. boulardii

 

В последние годы наблюдается активизация исследований, направленных на выделение представителей рода Lactobacillus и родственных им микроорганизмов [11, 12]. За последние 15 лет количество идентифицированных видов лактобацилл увеличилось с 80 до более чем двухсот, при этом продолжаются открытия новых видов, таких как Lactobacillus timonensis и Lactobacillus metrioptera [12, 13].

Лактобактерии могут быть выделены из почвы, хотя их количество в почве относительно невелико. Однако на границе растений и почвы, в частности, в ризосфере некоторых деревьев и съедобных грибов, их концентрация значительно выше. Некоторые штаммы, выделенные из этих экотопов, проявляют антимикробные свойства [12, 13, 14]. Поиск новых штаммов микроорганизмов, способных к сбраживанию лактозы, с целью разработки продуктов функционального питания, представляет значительный научный интерес [15, 16, 17]. Для усиления лечебно-профилактического эффекта функциональных продуктов питания эффективно применяются пробиотические бактерии [15, 16, 18, 19].

ЦЕЛЬЮ нашего исследования является анализ видового разнообразия микроорганизмов почвы Самарской области с описанием основных групп потенциально пробиотических микроорганизмов.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

В настоящем исследовании нами была проведена микробиологическая оценка сельскохозяйственных почв Похвистневского района Самарской области. Образцы были собраны в соответствии с авторской методикой сбора, обработкой и транспортировкой осенью 2022 года (патент на изобретение RU 2807931). Всего было собрано 75 образцов почвы. Образцы были отобраны на участках, расположенных рядом друг с другом, где применялись различные виды обработки почвы.

На каждом из участков отобрано по 5 точек по типу конверта (квадрат 100 на 100 м), зафиксированы координаты. Образцы отбирались на глубине 0-10 см и 10-20 см, а также были собраны растительные остатки с корнями (мульча). Образцы в полевых условиях (1 грамм) были законсервированы в 9 мл жидкой тиогликолевой среды с 10% содержанием. Далее образцы были заморожены для последующего анализа и культивирования.

Для бактериологического исследования использовали питательные среды: универсальный хромогенный агар (BioRad, США), агар Мюллера-Хинтон с добавлением 5% бараньей крови (HiMedia, Индия), агар Миддлбрука (HiMedia, Индия), агар Рогоза (HiMedia, Индия), маннит-солевой агар (HiMedia, Индия), агар для выделения Brucella spp. (HiMedia, Индия), агар для выделения Burkholderia cepacia complex (BCC) (HiMedia, Индия), ксилозо-лизиновый дезоксихолатный агар (HiMedia, Индия), цетримидный агар (HiMedia, Индия), дифференциальный агар Редди (HiMedia, Индия), глюкозный агар Эшби (HiMedia, Индия), агар для выделения Clostridium spp. (HiMedia, Индия), анаэробный агар (HiMedia, Индия), дифференциальный агар Редди (HiMedia, Индия), агар Сабуро (HiMedia, Индия) и гранулированный агар Чапека-Докса (HiMedia, Индия). Посев образцов осуществляли по методу Дригальского.

Инкубирование проводили в аэробных, микроаэрофильных и анаэробных условиях при 37оС. Идентификацию колоний микроорганизмов проводили с помощью методики MALDI-ToF масс-спектрометрии на приборе Microflex LT (Bruker Daltonics GmbH, Германия).

РЕЗУЛЬТАТЫ.

Во всех образцах почвы были обнаружены основные представители типичных обитателей желудочно-кишечного тракта, используемых в качестве пробиотиков: Bacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, Lactobacillus, Ligalactobacillus, Streptococcus. Структура по видовому разнообразию во всех образцах была различной и представлена в табл. 2.

Таблица 2.

Структура по видовому разнообразию микроорганизмов

Род

Вид

Aerococcus

сhristensenii, viridans

Bacillus

acidicola, altitudinis, amyloliquefaciens, aquimaris, atrophaeus, azotoformans, badius, benzoevorans, cereus, chungangensis, circulans, coagulans, cytotoxicus, endophyticus, flexus, fordii, fortis, funiculus, gibsonii, graminis, halotolerans, horikoshii, horti, idriensis, koreensis, licheniformis, luteolus, megaterium, mojavensis, mycoides, oleronius, pocheonensis, pseudomycoides, pumilus, safensis, seohaeanensis, shackletonii, siralis, sonorensis, sporothermodurans, subtilis, thermoamylovorans, thuringiensis, vallismortis, vireti

Bifidobacterium

animalis, minimum

Enterococcus

aquimarinus, avium, casseliflavus, columbae, faecalis, faecium, gallinarum, moraviensis, mundtii

Lactobacillus

acidophilus, amylolyticus, amylovorus, casei , concavus , crispatus, curvatus, delbrueckii, fructivorans, gasseri, graminis, hamsteri, helveticus, intestinalis, jensenii, kalixensis, kitasatonis, paralimentarius, paraplantarum, pentosus, plantarum, psittaci , rhamnosus, sakei, ultunensis, zeae

Ligalactobacillus

acidipiscis, agilis, aviarius, equi, murinus, ruminis, saerimneri, salivarius

Streptococcus

agalactiae, alactolyticus, canis, cristatus, devriesei, dysgalactiae, equi, ferus, gallolyticus, iniae, lutetiensis, minor, mitis, oralis, peroris, pneumonia, pseudopneumoniae, pseudoporcinus, pyogenes, salivarius, sanguinis, sobrinus, suis, uberis, vestibularis

 

Представитель рода Aerococcus, использующийся в пробиотических препаратах A. viridans был изолирован в 6,7% образцов почвы, на средах: агар Рогозы, маннит-солевой агар, дифференциальный агар Редди.

Было идентифицировано 45 различных видов рода Bacillus (рис. 1). Среди всех представителей можно выделить виды, которые используются в пробиотических препаратах: B. coagulans, B. subtilis, B. licheniformis и B. Indicus [18, 20]. B. licheniformis встретился в 44% образцов преимущественно на следующих средах: агар Рогозы, маннит-солевой агар, анаэробный агар. B. Subtilis встретился в 24% образцов на средах: агар Рогоза, глюкозный агар Эшби. B. coagulans был изолирован в 5,3% образцах преимущественно на глюкозном агаре Эшби и агаре Мюллера-Хинтон с добавлением 5% бараньей крови.

Среди представителей рода Lactobacillus (рис. 2) наиболее часто встречаемыми были следующие виды: L.jensenii и L.sakei были изолирована в 50,7% образцов, L.plantarum встречался в 46,7 % образцов. Данные виды изолированы основном на средах: агар Рогозы, маннит-солевой агар, агар Редди, универсальный хромогенный агар.

Пробиотический микроорганизм L.acidophilus изолирован в 41,3% образцов на следующих средах: агар Рогозы, агар для выделения Brucella spp., агар Мюллера-Хинтон с добавлением 5% бараньей крови, дифференциальный агар Редди, микроорганизм L.casei изолирован в 21,3% образцов на средах: агар для выделения Brucella spp., агар Рогозы, дифференциальный агар Редди. L. rhamnosus был изолирован в одном образце почве на глюкозном агаре Эшби.

Молочнокислые бактерии рода Ligilactobacillus (рис.3) в настоящее время активно изучаются и широко используются в качестве безопасной альтернативы антибиотикам [21, 22]. Наиболее часто встречался Lig. agilis - в 32% проб, чаще был изолирован в анаэробных условиях на средах: универсальный хромогенный агар, агар для выделения Brucella spp., агар Мюллера-Хинтон с добавлением 5% бараньей крови. Один из важных микроорганизмов, используемых в пробиотических препаратах, Lig. salivarius был изолирован в 24% образцах, наиболее часто встречался на средах: универсальный хромогенный агар, глюкозный агар Эшби и агар для выделения Clostridium spp.

Представители рода Bifidobacterium были обнаружены в небольшом видовом разнообразии: B.animalis и B.minimum. Данные микроорганизмы были однаружены в 3-х образцах почвы, при этом во всех 3-х случаях данные виды были изолированы в анаэробных условиях на средах: универсальный хромогенный агар, агар для выделения Clostridium spp. и дифференциальный агар Редди.

Самый часто встречаемый представитель рода Enterococcus - E. faecium был обнаружен в 68% образцов, изолирован преимущественно на средах: универсальный хромогенный агар, дифференциальный агар Редди, агар Рогозы, агар для выделения Clostridium spp., агар Мюллера-Хинтон с добавлением 5% бараньей крови. Второй по встречаемости вид E.faecalis был изолирован в 53,3% проб преимущественно на ниверсальном хромогенном агаре, агаре Рогозы и агаре для выделения Clostridium spp. Потенциально пробиотический микроорганизм E. mundtii изолирован в 2,7% образцов на агаре Рогозы и анаэробном агаре (рис.4).

Бактерии рода Streptococcus не являются типичными представителями микроорганизмов ЖКТ человека, больше всего они распространены в полости рта и на их основе разрабатываются пробиотические продукты. Обнаруженный в 4% образцов Str. salivarius является доминирующим представителем нормальной микрофлоры ротовой полости на протяжении всей жизни человека. Был изолирован в анаэробных условиях на агаре для выделения Brucella spp. и на агаре Мюллера-Хинтона с добавлением 5% бараньей крови (рис.5).

ОБСУЖДЕНИЕ.

Несмотря на высокую распространенность Bacillus в окружающей среде люди практически не получают эти микроорганизмы с пищей. К наиболее полезным эффектам бацилл можно отнести антимикробную активность, которую они проявляют как синтезом различных бактериоцинов и ингибицией факторов патогенности других бактерий (в том числе сигнальных факторов кворум-сенсинга), так и осуществлением феномена колонизационной резистентности. Например, повышенное представительство B. subtilis коррелирует с пониженной численностью клостридий, несущих патогенный потенциал, и с повышенной численностью бифидобактерий, более благоприятных для организма человека с метаболической точки зрения. Отдельные виды бацилл способны предотвращать колонизацию MRSA. Кроме того, они также способны стимулировать иммунную систему и участвовать в пищеварении хозяина. Новыми прогрессивными направлениями применения некоторых штаммов Bacillus являются их противоаллергенное и антитоксическое действие [20, 23, 24].

Изолированные виды B. coagulans, B. subtilis, B. licheniformis и B. indicus применяются в пробиотических препаратах [18, 20, 25]. Возможность их применения в этом направлении обусловлена различными природными особенностями данных микроорганизмов, а именно способностью к спорообразованию, устойчивости к кислой среде и солям желчных кислот – факторов, наличие которых характерно для ЖКТ. Также, сочетание некоторых штаммов Bacillus в одном пробиотическом продукте способствует избирательному подавлению различных патогенных микроорганизмов микрофлоры кишечника, также отмечено противоаллергическое и антитоксическое действие [25, 26].

Род Lactobacillus представляет особый интерес как полезные микроорганизмы из-за их долгой истории использования. Многочисленные исследования показали, что они могут изменять уровень pH, нейтрализовать патогены за счёт выработки соединений, обладающих противомикробными свойствами. Помимо применения в медицине, микробы, вырабатывающие фитазу, открывают большие перспективы для использования в пищевой промышленности при производстве продуктов питания для людей и кормов для животных. Добавление экзогенной фитазы используется для повышения биодоступности минералов [27], а дефитинизация, то есть добавление экзогенной фитазы в каши из различных злаковых культур, таких как кукуруза, овёс, рис и пшеница, повышает биодоступность железа для человека [28, 29].

По данным ряда авторов, было выявлено, что Lig.agilis проявляет пробиотическое и антибактериальное действие, он продемонстрировал высокую антибактериальную активность в отношении патогенной бактерии Klebsiella в кишечном тракте. Бактерия Ligilactobacillus salivarius имеет способность облегчать симптоматику воспалительных заболеваний кишечника и обладает способностью подавлять рост нескольких патогенов, таких как Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Salmonella typhimurium и S. enteritidis. Также данные виды бактерий устойчивы к солям желчных кислот и кислым средам желудка, что является одним из основных плюсов для пробиотиков, так как наличие солей желчных кислот и сильнокислых сред представляет собой наибольшее препятствие для выживания лактобактерий в желудочно-кишечном тракте [21, 22, 23].

Представители рода Bifidobacterium являются классическими представителями человеческого организма и также используются для разработки пробиотических препаратов. Bifidobacterium играют важную роль в механизме резистентности организма к инфекционным заболеваниям, подавляют жизнедеятельность гнилостных и патогенных микроорганизмов за счет продукции органических кислот, являются продуцентами биологически активных веществ, обладающих иммунокоррегирующим и противоопухолевым действием. В организме новорожденных образуют самую большую группу бактерий, с возрастом ее размер уменьшается. Кроме того, данный род расщепляют лактозу, синтезируют аминокислоты, снижают уровень холестерина, вырабатывают витамины К и группы В [29].

Другими неочевидными кандидатами на роль пробиотиков являются энтерококки. Эти микроорганизмы также широко представлены в окружающей среде и в составе продуктов питания, хотя в отличие от Bacillus они встречаются в составе кишечной микробиоты. Энтерококки относятся к молочнокислым микроорганизмам, осуществляя метаболизм бродильного типа и ферментирую углеводы, также снижая pH среды. Ранее они более широко использовались в качестве пробиотиков из-за вырабатываемых ими антимикробных бактериоцинов, называемых энтероцинами, из-за эффекта стимуляция иммунитета, противовоспалительной активности, гипохолестеринемического эффекта. Определенные штаммы энтерококков, такие как E. faecium и E. faecalis, включены в качестве пищевой добавки в несколько пробиотических препаратов [30].

Виды E. faecium и E.faecalis  издревле использовались для приготовления продуктов питания из мяса и овощей. Однако в последние годы использование энтерококков вызвало серьезные дебаты из-за их оппортунистической патогенности, связанной с возникновением внутрибольничных инфекций, и из-за их устойчивости к антибиотикам, особенно в связи с появлением устойчивых к ванкомицину штаммов. Данную проблему возможно решить следующим образом, необходимо анализировать генетический профиль, для разграничения потенциально опасных и полезных штаммов. Недавно был представлен как еще один потенциальный пробиотический микроорганизм E. mundtii.  Показана возможность выработки бактериоцинов, которые могут быть использованы для уничтожения грамотрицательных патогенов в желудочно-кишечном тракте млекопитающих, также они проявляют противовирусную активность в отношении вирусов простого герпеса, полиомиелита и кори [30, 31].

По данным ряда исследований Str. salivarius эффективен для профилактики инфекций дыхательных путей и ЛОР-органов, кандидоза полости рта, также данный микроорганизм способен ингибировать рост бактерий, отвечающих за галиоз [32].

ЗАКЛЮЧЕНИЕ.

Из полученных данных видно, что выявленные микроорганизмы, обитающие в почвенных покровах, могут быть использованы для разработки новых препаратов-пробиотиков. Так, большинство из них применяется в клинической практике для использования в желудочно-кишечном тракте (Bacillus, Bifidobacterium, Enterococcus, Lactobacillus, Ligilactobacillus).

В настоящее время происходит существенное изменение в теории о том, что пробиотические штаммы для лечения человека необходимо получать от человека. Опубликованы интересные данные о том, что найдены пробиотические штаммы Bacillus subtilis в арктических почвах. Он способен подавлять рост MRSA, а при внутрибрюшном введении у животных не вызывал воспалительных реакции и септических осложнений. Также существуют исследования, посвященные, выделению штаммов сенной палочки с поверхности лекарственных трав, по результатам которых к эффектам от лечения такими травами добавлялся пробиотический компонент за счет содержания в них спор и вегетативных форм B. subtilis.

Особо перспективным считается пробиотик на основе Ligilactobacillus salivarius, так как его многочисленные штаммы демонстрируют полезные для здоровья свойства, такие как антимикробная активность и способность влиять на иммунную систему [23].

Однако некоторые микроорганизмы возможно применять в других частях организма, в том числе в ротовой полости (Streptococcus), последний является особо перспективным пробиотиком для профилактики и лечения инфекционных заболеваний и сохранения здоровья микробиоты ротовой полости.

Рис. 1. Видовое разнообразие рода Bacillus. По оси Y - количество образцов почвы, содержащих микроорганизмы, %.

Рис. 2. Видовое разнообразие рода Lactobacillus. По оси Y - количество образцов почвы, содержащих микроорганизмы, %.

Рис. 3. Видовое разнообразие рода Ligilactobacillus. По оси - Y количество образцов почвы, содержащих микроорганизмы.

Рис. 4. Видовое разнообразие рода Enterococcus. По оси Y - количество образцов почвы, содержащих микроорганизмы, %.

Рис. 5. Видовое разнообразие рода Streptococcus. По оси Y - количество образцов почвы, содержащих микроорганизмы, %.

×

About the authors

Dariya S. Tupikova

Federal State Budgetary Educational Institution of Higher Education «Samara State Medical University» of the Ministry of Healthcare of the Russian Federation

Author for correspondence.
Email: Typikovads@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-2813-7271
SPIN-code: 3234-9993

PhD, Associate Professor of the Department of Nutrition Hygiene with a course of hygiene of children and adolescents

Russian Federation, 443099, Российская Федерация, г. Самара, ул. Чапаевская, 89

Alexey S. Sustretov

Email: a.s.sustretov@samsmu.ru
ORCID iD: 0000-0002-3021-2130
SPIN-code: 9001-7233

Olga V. Sazonova

ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России

Email: o.v.sazonova@samsmu.ru
ORCID iD: 0000-0002-4130-492X
SPIN-code: 1789-6104

д.м.н., профессор

Russian Federation, 443099, Российская Федерация, г. Самара, ул. Чапаевская, 89

Artem V. Lyamin

ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России

Email: a.v.lyamin@samsmu.ru
ORCID iD: 0000-0002-5905-1895
SPIN-code: 6607-8990

д.м.н., доцент 

Russian Federation, 443099, Российская Федерация, г. Самара, ул. Чапаевская, 89

Elena A. Zakharova

ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России

Email: e.a.zakharova@samsmu.ru
ORCID iD: 0000-0003-0012-5762
SPIN-code: 7123-5503
Russian Federation, 443099, Российская Федерация, г. Самара, ул. Чапаевская, 89

Karim A. Kayumov

ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России

Email: k.a.kayumov@samsmu.ru
ORCID iD: 0000-0002-9614-7255
SPIN-code: 3614-7790
Russian Federation, 443099, Российская Федерация, г. Самара, ул. Чапаевская, 89

Dmitry V. Alekseev

ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России

Email: d.v.alekseev@samsmu.ru
ORCID iD: 0000-0002-8864-4956
SPIN-code: 6991-8918
Russian Federation, 443099, Российская Федерация, г. Самара, ул. Чапаевская, 89

References

  1. Barylnik Yu.B., Shuldyakov A.A., Filippova N.V., Ramazanova K.H. The human intestinal microbiome and mental health: the state of the problem // Russian Psychiatric Journal. 2015. No. 3. pp. 30-41
  2. Usenko D.V., Gorelov A.V. Probiotics and probiotic products: Possibilities and prospects of application // Issues of modern pediatrics. 2004. Vol. 3. no.2. - pp. 50-54
  3. Kirpichenko A.A., Kim I.Y. Probiotics: is the intestinal microflora capable of influencing human mental health? // Bulletin of VSMU. 2017, vol.16, No. 2, pp. 26-42. DOI: https://doi.org/10.22263/2312-4156.2017.2.26
  4. Wikoff W.R., Anfora A.T., Liu J., Schultz P.G., Lesley S.A., Peters E.C., Siuzdak G. Metabolomics analysis reveals large effects of gut microflora on mammalian blood metabolites // Proc Nat Acad Sci U.S.A. 2009. 106(10). 3698-703. doi: 10.1073/pnas.0812874106.
  5. O’Hara A.M., Shanahan F. The gut flora as a forgotten organ // EMBO. 2006. Rep. 7, 688-693. doi: 10.1038/sj.embor.7400731
  6. Linz B., Balloux F., Moodley Y., Manica A., Liu H., Roumagnac P., Falush D., Stamer C., Prugnolle F., van der Merwe S.W., Yamaoka Y., Graham D.Y., Perez-Trallero E., Wadstrom T., Suerbaum S., Achtman M. An African origin for the intimate association between humans and Helicobacter pylori // Nature. 2007 Feb 22;445(7130):915-918. doi: 10.1038/nature05562
  7. Holzapfel W.H. Appropriate starter culture technologies for small-scale fermentation in developing countries // Int J Food Microbiol. 2002 May 25;75(3):197-212. doi: 10.1016/s0168-1605(01)00707-3
  8. Lee I.C., van Swam I.I., Boeren S., Vervoort J., Meijerink M., Taverne N., Starrenburg M., Bron P.A., Kleerebezem M. Lipoproteins Contribute to the Anti-inflammatory Capacity of Lactobacillus plantarum WCFS1 // Front Microbiol. 2020 Jul 29;11:1822. doi: 10.3389/fmicb.2020.01822
  9. Rook G.A., Lowry C.A., Raison C.L. Microbial 'Old Friends', immunoregulation and stress resilience // Evol Med Public Health. 2013 Jan;2013(1):46-64. doi: 10.1093/emph/eot004
  10. Comas I., Coscolla M., Luo T., Borrell S., Holt K.E., Kato-Maeda M., Parkhill J., Malla B., Berg S., Thwaites G., Yeboah-Manu D., Bothamley G., Mei J., Wei L., Bentley S., Harris S.R., Niemann S., Diel R., Aseffa A., Gao Q., Young D., Gagneux S. Out-of-Africa migration and Neolithic coexpansion of Mycobacterium tuberculosis with modern humans // Nat Genet. 2013 Oct;45(10):1176-82. doi: 10.1038/ng.2744
  11. Rook GAW. The old friends hypothesis: evolution, immunoregulation and essential microbial inputs // Front Allergy. 2023 Sep 12;4:1220481. doi: 10.3389/falgy.2023.1220481
  12. Rook G.A., Raison C.L., Lowry C.A. Microbiota, immunoregulatory old friends and psychiatric disorders // Adv Exp Med Biol. 2014;817:319-56. doi: 10.1007/978-1-4939-0897-4_15
  13. Zuany-Amorim C., Sawicka E., Manlius C., Le Moine A., Brunet L.R., Kemeny D.M., Bowen G., Rook G., Walker C. Suppression of airway eosinophilia by killed Mycobacterium vaccae-induced allergen-specific regulatory T-cells // Nat Med. 2002 Jun;8(6):625-9. doi: 10.1038/nm0602-625
  14. Molino S., Lerma-Aguilera A., Jiménez-Hernández N., Rufián Henares J.Á., Francino M.P. Evaluation of the Effects of a Short Supplementation with Tannins on the Gut Microbiota of Healthy Subjects // Front Microbiol. 2022 Apr 27;13:848611. doi: 10.3389/fmicb.2022.848611
  15. Shenderov B.A. Metabiotics: novel idea or natural development of probiotic conception // Microb Ecol Health Dis. 2013 Apr 12;24. doi: 10.3402/mehd.v24i0.20399
  16. Hempel S., Newberry S., Ruelaz A., Wang Z., Miles J.N., Suttorp M.J., Johnsen B., Shanman R., Slusser W., Fu N., Smith A., Roth B., Polak J., Motala A., Perry T., Shekelle P.G. Safety of probiotics used to reduce risk and prevent or treat disease // Evid Rep Technol Assess (Full Rep). 2011 Apr;(200):1-645
  17. Zawistowska-Rojek A., Tyski S. Are Probiotic Really Safe for Humans? // Pol J Microbiol. 2018;67(3):251-258. doi: 10.21307/pjm-2018-044
  18. Guilherme L., Kalil J., Cunningham M. Molecular mimicry in the autoimmune pathogenesis of rheumatic heart disease // Autoimmunity. 2006 Feb;39(1):31-9. doi: 10.1080/08916930500484674
  19. Kiseleva E.P., Mikhailopulo K.I., Sviridov O.V., Novik G.I., Knirel Y.A., Szwajcer Dey E. The role of components of Bifidobacterium and Lactobacillus in pathogenesis and serologic diagnosis of autoimmune thyroid diseases // Benef Microbes. 2011 Jun;2(2):139-54. doi: 10.3920/BM2010.0011
  20. Van Reenen C.A., Dicks L.M. Horizontal gene transfer amongst probiotic lactic acid bacteria and other intestinal microbiota: what are the possibilities? // A review. Arch Microbiol. 2011 Mar;193(3):157-68. doi: 10.1007/s00203-010-0668-3
  21. O' Donnell M.M., Harris H.M., Lynch D.B., Ross R.P., O'Toole P.W. Lactobacillus ruminis strains cluster according to their mammalian gut source // BMC Microbiol. 2015 Apr 1;15:80. doi: 10.1186/s12866-015-0403-y
  22. Carbonne C., Chadi S., Kropp C., Molimard L., Chain F., Langella P., Martin R. Ligilactobacillus salivarius CNCM I-4866, a potential probiotic candidate, shows anti-inflammatory properties in vitro and in vivo // Front. Microbiol. 2023. 14:1270974. doi: 10.3389/fmicb.2023.1270974
  23. Fei Shen, Qianqian Wang, Sami Ullah, Ya Pan, Minjie Zhao, Jing Wang, Ming Chen, Fengqin Feng, Hao Zhong. Ligilactobacillus acidipiscis YJ5 modulates the gut microbiota and produces beneficial metabolites to relieve constipation by enhancing the mucosal barrier // Food & Function. 2024. 15. Р.310-325. doi: 10.1039/D3FO03259K
  24. Cherevina E.A., Stepycheva N.V. The role of probiotics in maintaining the formation of cells of the intestinal immune system // IN SITU. 2022. No. 11 – pp. 143-147. ISSN (p) 2411-7161 / ISSN (e) 2712-9500
  25. Trukhan D.I. Disorders of intestinal microbiocenosis: expanding the scope of probiotics // Medical Council. 2022. 16(7). pp.132-143. https://doi.org/10.21518/2079-701X-2022-16-7-132-143
  26. Al-Fakhrany O.M., Elekhnawy E. Next-generation probiotics: the upcoming biotherapeutics // Mol Biol Rep. 2024 Apr 15;51(1):505. doi: 10.1007/s11033-024-09398-5
  27. Ma J., Lyu Y., Liu X., Jia X., Cui F., Wu X., Deng S., Yue C. Engineered probiotics // Microb Cell Fact. 2022 Apr 27;21(1):72. doi: 10.1186/s12934-022-01799-0
  28. Mattoo R., Mallikarjuna S. Soil microbiome influences human health in the context of climate change // Future Microbiol. 2023 Aug; 18:845-859. doi: 10.2217/fmb-2023-0098
  29. Blum WEH, Zechmeister-Boltenstern S, Keiblinger KM. Does Soil Contribute to the Human Gut Microbiome? // Microorganisms. 2019 Aug 23;7(9):287. doi: 10.3390/microorganisms7090287
  30. Riva V., Mapelli F., Bagnasco A., Mengoni A., Borin S. A Meta-Analysis Approach to Defining the Culturable Core of Plant Endophytic Bacterial Communities // Appl Environ Microbiol. 2022 Mar 22;88(6):e0253721. doi: 10.1128/aem.02537-21
  31. Soares A., Edwards A., An D., Bagnoud A., Bradley J., Barnhart E., Bomberg M., Budwill K., Caffrey S.M., Fields M., Gralnick J., Kadnikov V., Momper L., Osburn M., Mu A., Moreau J.W., Moser D., Purkamo L., Rassner S.M., Sheik C.S., Sherwood Lollar B., Toner B.M., Voordouw G., Wouters K., Mitchell A.C. A global perspective on bacterial diversity in the terrestrial deep subsurface // Microbiology (Reading). 2023 Jan;169(1):001172. doi: 10.1099/mic.0.001172
  32. Gritsinskaya, V.L. Probiotics: classification, main characteristics, requirements for probiotic strains and their scope of application // Children's Medicine of the North-West. 2022. Vol. 10. № 3. – pp. 12-20
  33. Savlevich E.L., Doroshchenko N.E., Zharkikh M.A., Markus P.V., Gerasimov A.N. Correction of halitosis in chronic inflammatory diseases of the oropharynx in adults // Bulletin of otorhinolaryngology. 2021. 86(6). – pp.42-47. https://doi.org/10.17116/otorino20218606142

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) Eco-Vector

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № ФС 77 - 78166 от 20.03.2020.