Ekologiya cheloveka (Human Ecology)Ekologiya cheloveka (Human Ecology)Экология человека1728-08692949-1444Eco-Vector1676010.33396/1728-0869-2017-10-34-38ArticlesСтатьиResearch ArticleROLE OF POLYMORPHIC VARIANTS OF THE GENES TNFA, TSLP IN THE OCCUPATIONAL ASTHMA DEVELOPMENTРоль полиморфных вариантов генов TNFA, TSLP в развитии профессиональной бронхиальной астмыMukhammadiyevaG FМухаммадиеваГузель Фанисовна

кандидат биологических наук, заведующий лабораторией молекулярногенетических исследований отдела токсикологии и генетики

ufniimt@mail.ruKutlinaT GКутлинаТ ГKarimovD OКаримовД ОBakirovA BБакировА БShagalinaA UШагалинаА УIdiyatullinaE FИдиятуллинаЭ ФUfa Research Institute of Occupational Health and Human EcologyФБУН «Уфимский НИИ медицины труда и экологии человека»151020172410NO10 (2017)№10 (2017)343823102019Copyright ©; 2017, Human EcologyCopyright ©; 2017, Экология человека2017Human EcologyЭкология человекаhttps://hum-ecol.ru/1728-0869/article/view/16760

The aim of the study was to find possible associations of polymorphic variants rs1800629 of gene TNFA and rs1837253 of gene TSLP with the development of occupational asthma. The analysis of polymorphism of cytokine genes was carried out by means of polymerase chain reaction of DNA synthesis in 83 patients and 195 control subjects. Genomic DNA was isolated from whole blood samples using standard phenol/chloroform extraction techniques. Statistical analysis was performed using χ test as amended by Yeats and odds ratios with 95 % confidence intervals. As a result, it found that in patients with occupational asthma allele C and genotype CC polymorphic locus rs1837253 TSLP gene occurs more frequently (OR = 1.91, 95 % CI 1.11-3.28; p = 0,026 и OR = 2.48, 95 % CI 1.29-4.77; p = 0.010 respectively) than in the control group. The analysis of the association of polymorphic locus rs1800629 TNFA gene with occupational asthma did not reveal statistically significant results. The received data suggest the possible involvement of rs1837253 polymorphism TSLP gene in the formation of occupational asthma.

Цель работы заключалась в поиске возможных ассоциаций полиморфных вариантов rs1800629 гена TNFA и rs1837253 гена TSLP с развитием профессиональной бронхиальной астмы. Анализ полиморфизма генов цитокинов проведен методом полимеразной цепной реакции синтеза ДНК у 83 больных и 195 лиц контрольной группы. Геномную ДНК выделяли из цельной крови посредством стандартной экстракции фенолом-хлороформом. Статистический анализ проводили с использованием критерия χ2 с учетом поправки Йетса и отношения шансов с 95 % доверительными интервалами. В результате исследования обнаружено, что у больных профессиональной бронхиальной астмой аллель C и генотип CC полиморфного локуса rs1837253 гена TSLP встречаются чаще (OR = 1,91, 95 % CI 1,11-3,28; p = 0,026 и OR = 2,48, 95 % CI 1,29-4,77; p = 0,010 соответственно), чем у лиц контрольной группы. Анализ ассоциации полиморфного локуса rs1800629 гена TNFA с развитием профессиональной бронхиальной астмы не выявил статистически значимых результатов. Полученные данные дают основание предполагать возможное участие полиморфного варианта rs1837253 гена TSLP в формировании профессиональной бронхиальной астмы.

occupational asthmariskgene polymorphismпрофессиональная бронхиальная астмарискполиморфизм геновБакумов П.А., Ковальская Е.Н., Зернюкова Е.А., Кочетова Е.И., Алексеев Е.Г. Профессиональная бронхиальная астма // Лекарственный вестник. 2014. № 1 (53). С. 18-30.Иващенко Т.Э., Останкова Ю.А., Баранов В.С. Анализ полиморфизма гена фактора некроза опухоли-а у больных с атопической бронхиальной астмой // Медицинская генетика. 2005. Т. 4, № 5. С. 195.Сеитова Г.Н., Букреева Е.Б., Кремис И.С., Пузырев В.П. Ассоциация полиморфных вариантов генов цитокинов (TNF и IL8) с развитием хронической обструктивной болезни легких // Бюллетень сибирской медицины. 2010. Т. 9, № 3. С. 91-97.Черкашина И.И., Никулина С.Ю., Логвиненко Н.И. Максимов В.Н., Либердовская Е.Д. Клинико-генетический анализ больных бронхиальной астмой // Пульмонология. 2009. № 2. С. 77-81.Albuquerque R.V., Hayden C.M., Palmer L.J., Laing I.A., Rye P.J., Gibson N.A., Burton P.R., Goldblatt J., Lesouëf P.N. Association of polymorphisms within the tumour necrosis factor (TNF) genes and childhood asthma // Clin. Exp. Allergy. 1998. Vol. 28, N 5. P. 578-584.Allakhverdi Z., Comeau M.R., Jessup H.K., Yoon B.R., Brewer A., Chartier S., Paquette N., Ziegler S. F., Sarfati M., Delespesse G. Thymic stromal lymphopoietin is released by human epithelial cells in response to microbes, trauma, or inflammation and potently activates mast cells // Exp. Med. 2007. Vol. 204, N 2. P. 253-258.Almomani B., Hawwa A.F., Millership J.S., Heaney L., Douglas I., McElnay J.C., Shields M.D. Can certain genotypes predispose to poor asthma control in children? A pharmacogenetic study of 9 candidate genes in children with difficult asthma // PLoS One. 2013. Vol. 8, N 4. P. e60592.Aoki T., Hirota T., Tamari M., Ichikawa K., Takeda K., Arinami T., Shibasaki M., Noguchi E. An association between asthma and TNF-308G/A polymorphism: meta-analysis // J. Hum. Genet. 2006. Vol. 51, N 8. P. 677-685.Bucková D., Holla L. I., Vasků A. Znojil V., Vächa J. Lack of association between atopic asthma and the tumor necrosis factor alpha-308 gene polymorphism in a Czech population // J Investig Allergol Clin Immunol. 2002. Vol. 12, N 3. P. 192-197.Fan H.M., Wang Z., Feng F.M., Zhang K.L., Yuan J.X., Sui H., Qiu H.Y., Liu L.H., Deng X.J., Ren J.X. Association of TNF-alpha-238G/A and 308 G/A gene polymorphisms with pulmonary tuberculosis among patients with coal worker’s pneumoconiosis // Biomed Environ Sci. 2010. Vol. 23, N 2. P. 137-145.He J.Q., Hallstrand T.S., Knight D., Chan-Yeung M., Sandford A., Tripp B., Zamar D., Bossé Y., Kozyrskyj A.L., James A., Laprise C., Daley D. A thymic stromal lymphopoietin gene variant is associated with asthma and airway hyperresponsiveness // J Allergy Clin Immunol. 2009. Vol. 124, N 2. P. 222-229.Huang H., Nie W., Qian J., Zang Y., Chen J., Lai G., Ye T., Xiu Q. Effects of TNF-а polymorphisms on asthma risk: a systematic review and meta-analysis // J Investig Allergol Clin Immunol. 2014. Vol. 24, N 6. P. 406-417.Hunninghake G.M., Soto-Quiros M.E., Avila L., Kim H.P., Lasky-Su J., Rafaels N., Ruczinski I., Beaty T.H., Mathias R.A., Barnes K.C., Wilk J.B., O’Connor G.T., Gauderman W.J., Vora H., Baurley J. W., Gilliland F., Liang C., Sylvia J.S., Klanderman B. J., Sharma S. S., Himes B. E., Bossley C. J., Israel E., Raby B.A., Bush A., Choi A.M., Weiss S.T., Celedon J.C. TSLP polymorphisms are associated with asthma in a sex-specific fashion // Allergy. 2010. Vol. 65, N 12. Р. 1566-1575.Kim H.B., Kang M.J., Lee S.Y., Jin H.S., Kim J.H., Kim B.S., Jang S.O., Lee Y.C., Sohn M.H., Kim K.E., Hong S.J. Combined Effect of Tumour Necrosis FactorAlpha and Interleukin-13 Polymorphisms on Bronchial Hyperresponsiveness in Korean Children with Asthma // Clin. Exp. Allergy. 2008. Vol. 38, N 5. P. 774-780.Kroeger K.M., Carville K.S., Abraham L.J. The -308 tumor necrosis factor-a promoter polymorphism effects transcription // Mol Immunol. 1997. Vol. 34, N 5. P. 391-399.Liu Y.J., Soumelis V., Watanabe N., Ito T., Wang Y.H., Malefyt Rde. W., Omori M., Zhou B., Ziegler S. F. TSLP: anepithelial cell cytokine that regulates T cell differentiation by conditioning dendritic cell maturation // Annu Rev Immunol. 2007. N 25. P. 193-219.Randolph A.G., Lange C., Silverman E.K. Lazarus R., Weiss S.T. Extended haplotype in the tumor necrosis factor gene cluster is associated with asthma and asthma-related phenotypes // Am J Respir Crit Care Med. 2005. Vol. 172, N 6. P. 687-692.Sandford A.J., Chan H.W., Wong G.W., Lai C.K., Chan-Yeung M. Candidate Genetic Polymorphisms for Asthma in Chinese School-children from Hong Kong // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. 2004. Vol. 8, N 5. P. 519-527.Shin H.D., Park B.L., Kim L.H., Jung J.H., Wang H.J, Kim Y.J, Park H.S., Hong S.J., Choi B.W., Kim D.J., Park C.S. Association of tumor necrosis factor polymorphisms with asthma and serum total IgE // Hum Mol Genet. 2004. Vol. 13, N 3. P. 397-403.Ying S., O’Connor B., Ratoff J., Meng Q., Fang C., Cousins D., Zhang G., Gu S., Gao Z., Shamji B., Edwards M. J., Lee T. H., Corrigan C. J. Expression and cellular provenance of thymic stromal lymphopoietin and chemokines in patients with severe asthma and chronic obstructive pulmonary disease // J. Immunol. 2008. Vol. 181, N 4. P. 2790-2798.Zhang S., Wang C., Xi B., Li X. Association between the tumour necrosis factor-a-308G/A polymorphism and chronic obstructive pulmonary disease: an update // Respirology. 2011. Vol. 16, N 1. P. 107-115.Zhang Y., Zhang J., Tian C., Xiao Y., He C., Li X., Bogati A., Huang J., Fan H. The -308 G/A polymorphism in TNF-a gene is associated with asthma risk: an update by meta-analysis // J Clin Immunol. 2011. Vol. 31, N 2. P. 174-185.