Бактериальные сообщества, ассоциированные с пресноводным моллюском Kamtschaticana kamtschatica (Middendorff, 1850), в Северо-Восточной Сибири

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

В работе получены первые сведения о микробных сообществах, ассоциированных с пресноводным моллюском Kamtschaticana kamtschatica, населяющим разнотипные водоемы Восточной Сибири и Дальнего Востока России. С использованием данных метабаркодирования на основе фрагментов генов 16S рРНК проведено таксономическое профилирование бактериальных сообществ, ассоциированных с моллюсками, из трех водоемов Магаданской области. Показано, что преобладающими филумами в изучаемых бактериальных сообществах являются: Pseudomonadota, Bacillota, Cyanobacteriota, Actinomycetota, Verrucomicrobiota, Planctomycetota и Bacteroidota. Максимальное α-разнообразие бактерий по индексу Chao1 характерно для моллюсков из Оротуканского водохранилища. Относительная численность бактерий родов Snowella, Leptolyngbya, Nodosilinea, Arenimonas и Polaromonas существенно отличает моллюска данного местообитания от двух других. Наибольшие сходства в составе микробиоты у K. kamtschatica проявляются по роду Pseudomonas, присутствующего в большинстве образцов в количестве более 1% и не обнаруженного в образцах грунта. Полученные данные о разнообразии и составе бактериальных сообществ, ассоциированных с прудовиками, имеют фундаментальное значение для экологии пресноводных моллюсков.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

А. С. Аксенов

Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики УрО РАН им. академика Н.П. Лаверова; Северный (Арктический) федеральный университет им. М.В. Ломоносова

Автор, ответственный за переписку.
Email: a.s.aksenov@narfu.ru
Россия, Архангельск, 163020; Архангельск, 163002

О. Я. Кисиль

Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики УрО РАН им. академика Н.П. Лаверова; Северный (Арктический) федеральный университет им. М.В. Ломоносова

Email: s.aksenov@narfu.ru
Россия, Архангельск, 163020; Архангельск, 163002

А. С. Червочкина

Северный (Арктический) федеральный университет им. М.В. Ломоносова

Email: s.aksenov@narfu.ru
Россия, Архангельск, 163002

И. С. Хребтова

Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики УрО РАН им. академика Н.П. Лаверова

Email: s.aksenov@narfu.ru
Россия, Архангельск, 163020

К. С. Манцурова

Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики УрО РАН им. академика Н.П. Лаверова; Северный (Арктический) федеральный университет им. М.В. Ломоносова

Email: s.aksenov@narfu.ru
Россия, Архангельск, 163020; Архангельск, 163002

Ю. В. Беспалая

Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики УрО РАН им. академика Н.П. Лаверова

Email: s.aksenov@narfu.ru
Россия, Архангельск, 163020

О. В. Аксенова

Федеральный исследовательский центр комплексного изучения Арктики УрО РАН им. академика Н.П. Лаверова

Email: s.aksenov@narfu.ru
Россия, Архангельск, 163020

Список литературы

  1. Недолужко А.В., Кадников В.В., Белецкий А.В., Шарко Ф.С., Цыганкова С.В., Марданов А.В., Равин Н.В., Скрябин К.Г. Микроорганизмы, ассоциированные с микронасекомыми Megaphragma amalphitanum и Scydosella musawasensis // Микробиология. 2017. Т. 86. C. 520–522.
  2. Nedoluzhko A.V., Kadnikov V.V., Beletsky A.V., Sharko F.S., Tsygankova S.V., Mardanov A.V., Ravin N.V., Skryabin K.G. Microorganisms associated with microscopic insects Megaphragma amalphitanum and Scydosella musawasensis // Microbiology (Moscow). 2017. V. 86. P. 532‒533.
  3. Aldridge D.C., Ollard I., Bespalaya Y.V., Bolotov I.N., Douda K., Geist J., Haag W.R., Klunzinger M.W., Lopes-Lima M., Mlambo M.C., Riccardi N., Sousa R., Strayer D.L., Torres S.H., Vaughn C.C., Zając T., Zieritz A. Freshwater mussel conservation: a global horizon scan of emerging threats and opportunities // Global Change Biol. 2022. V. 29. P. 575–589.
  4. Bespalaya Y.V., Aksenova O.V., Bolotov I.N., Aksenov A.S. Freshwater mollusks in lakes of the Solovetsky Islands (White Sea) // Lake Water: Properties and Uses (Case Studies of Hydrochemistry and Hydrobiology of Lakes in Northwest Russia). Ch. 10. N.Y.: Nova Sci. Publishers, 2021. P. 249‒267.
  5. Böhm M., Dewhurst-Richman N.I., Seddon M., Ledger S.E.H., Albrecht C., Allen D., Bogan A.E., Cordeiro J. et al. The conservation status of the world’s freshwater molluscs // Hydrobiologia. 2021. V. 848. P. 3231–3254.
  6. Carella F., Aceto S., Pollaro F., Miccio A., Iaria C., Carrasco N., Prado P., De Vico G. A mycobacterial disease is associated with the silent mass mortality of the pen shell Pinna nobilis along the Tyrrhenian coastline of Italy // Sci. Rep. 2019. V. 9. Art. 2725.
  7. Chiarello M., Bucholz J.R., McCauley M., Vaughn S.N., Hopper G.W., Gonzalez I.S., Atkinson C.L., Lozier J.D., Jackson C.R. Environment and co-occuring native mussel species, but not host genetics, impact the microbiome of a freshwater invasive species (Corbicula fluminea) // Front. Microbiol. 2022. V. 13. Art. 800061.
  8. Dar M.A., Pawar K.D., Pandit R.S. Gut microbiome analysis of snails: a biotechnological approach // Organismal and Molecular Malacology / Ed. S. Ray. InTech., 2017. P. 189–217.
  9. Hu Z., Chen X., Chang J., Yu J., Tong Q., Li S., Niu H. Compositional and predicted functional analysis of the gut microbiota of Radix auricularia (Linnaeus) via high-throughput Illumina sequencing // PeerJ. 2018. V. 6. Art. e5537.
  10. Kivistik C., Kairo K., Tammert H., Sokolova I.M., Kisand V., Herlemann D.P.R. Distinct stages of the intestinal bacterial community of Ampullaceana balthica after salinization // Front. Microbiol. 2022. V. 13. Art. 767334.
  11. Marzocchi U., Bonaglia S., Zaiko A., Quero G.M., Vybernaite-Lubiene I., Politi T., Samuiloviene A., Zilius M., Bartoli M., Cardini U. Zebra mussel holobionts fix and recycle nitrogen in lagoon sediments // Front. Microbiol. 2021. V. 11. Art. 610269.
  12. Richard J.C., Campbell L.J., Leis E.M., Agbalog R.E., Dunn C.D., Waller D.L., Knowles S., Putnam J.G., Goldberg T.L. Mussel mass mortality and the microbiome: evidence for shifts in the bacterial microbiome of a declining freshwater bivalve // Microorganisms. 2021. V. 9. Art. 1976.
  13. Schols R., Vanoverberghe I., Huyse T., Decaestecker E. Host-bacteriome transplants of the schistosome snail host Biomphalaria glabrata reflect species-specific associations // FEMS Microbiol. Ecol. 2023. V. 99. P. 1–9.
  14. Vinarski M.V., Aksenova O.V., Bespalaya Yu.V., Kondakov A.V., Tomilova A.A., Khrebtova I.S., Gofarov M.Yu., Bolotov I.N. One beringian genus less: a re-assesment of Pacifimyxas Kruglov & Starobogatov, 1985 (Mollusca: Gastropoda: Lymnaeidae) questions the current estimates of beringian biodiversity // J. Zool. Syst. Evol. Res. 2021. V. 59. P. 44–59.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Карта-схема района исследований с указанием мест отбора образцов: SEIM — р. Сеймчан (синие точки); ORO — Оротуканское водохранилище (зеленые точки); MAG — пойменное озеро в устье р. Магаданка (красные точки). Масштабная линейка для раковин моллюсков — 2.5 мм.

Скачать (257KB)
Метаданные
3. Рис. 2. α-Разнообразие (а) и таксономический состав (б) бактериальных сообществ, ассоциированных с прудовиками Kamtschaticana kamtschatica, и грунтов в пресных водоемах Магаданской области.

Скачать (329KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024